Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CD40LGP29965 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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