Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMB4P28070 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms