Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPD1P21695 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms