Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX7O95931 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms