Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM63AO94886 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM63AO94886 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM63AO94886 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TMEM63AO94886 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM63AO94886 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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