Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBAG9O00559 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms