Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms