Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLHL42Q9P2K6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms