Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PLVAPQ9BX97 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms