Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFHD1Q9BUP0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFHD1Q9BUP0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms