Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED9Q6R2W3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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