Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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