Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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