Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CDH18Q13634 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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