Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LSAMPQ13449 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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LSAMPQ13449 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LSAMPQ13449 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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