Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CALD1Q05682 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms