Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SPRR1AP35321 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms