Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms