Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LNPKQ9C0E8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms