Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZYG11BQ9C0D3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms