Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM15Q9C019 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRIM15Q9C019 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms