Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SNHG12Q9BXW3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms