Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NDFIP1Q9BT67 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms