Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF4BQ92750 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms