Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC12Q8WUD4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms