Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms