Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDZK1Q5T2W1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDZK1Q5T2W1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDZK1Q5T2W1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDZK1Q5T2W1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDZK1Q5T2W1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PDZK1Q5T2W1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDZK1Q5T2W1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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