Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms