Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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HIST3H3Q16695 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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HIST3H3Q16695 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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