Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SEC23BQ15437 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms