Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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