Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDK5R2Q13319 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms