Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IRF8Q02556 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms