Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ID3Q02535 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ID3Q02535 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms