Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
IFITM3Q01628 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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