Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms