Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP4P49662 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP4P49662 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP4P49662 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASP4P49662 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms