Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACADSBP45954 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms