Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTHFRP42898 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms