Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXC13P31276 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms