Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ALDH4A1P30038 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms