Protein–RNA interactions for Protein: P24311

COX7B, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7BP24311 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
COX7BP24311 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
COX7BP24311 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
COX7BP24311 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms