Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRRD1A4D1F6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms