Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SETBP1Q9Y6X0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SETBP1Q9Y6X0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SETBP1Q9Y6X0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SETBP1Q9Y6X0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms