Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX10Q9Y5X0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX10Q9Y5X0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX10Q9Y5X0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms