Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNPO3Q9Y5L0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNPO3Q9Y5L0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms