Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKP3Q9Y446 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKP3Q9Y446 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKP3Q9Y446 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms