Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSX2IPQ9Y2D8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSX2IPQ9Y2D8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms