Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLEC11AQ9Y240 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLEC11AQ9Y240 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLEC11AQ9Y240 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLEC11AQ9Y240 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms