Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF3IP3Q9Y228 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAF3IP3Q9Y228 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms